Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA6P23229 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA6P23229 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms