Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XPAP23025 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XPAP23025 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XPAP23025 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XPAP23025 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XPAP23025 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XPAP23025 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
XPAP23025 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms