Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACGP22612 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms