Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD247P20963 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD247P20963 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms