Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRHP20396 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRHP20396 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRHP20396 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRHP20396 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRHP20396 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRHP20396 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRHP20396 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms