Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms