Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms