Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms