Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRT3P12035 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT3P12035 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT3P12035 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT3P12035 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT3P12035 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms