Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms