Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms