Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSBP07858 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSBP07858 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms