Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA4P06727 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms