Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APODP05090 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APODP05090 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APODP05090 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms