Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms