Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPINC1P01008 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms