Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C6orf47O95873 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms