Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRATO95237 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRATO95237 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRATO95237 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRATO95237 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRATO95237 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRATO95237 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms