Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCTN3O75935 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms