Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKNO60260 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKNO60260 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms