Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP9BO43861 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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