Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAB2O43741 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms