Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNPHO15079 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNPHO15079 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNPHO15079 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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