Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR6O00574 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms