Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms