Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf58C9J3I9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms