Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms