Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms