Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms