Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLXND1Q9Y4D7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXND1Q9Y4D7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms