Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAN1Q9Y2M0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms