Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms