Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBE1Q9UJT0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.1 ms