Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms