Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms