Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTRRQ9UBK8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms