Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GALPQ9UBC7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms