Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms