Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EHD3Q9NZN3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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