Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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