Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNAJC28Q9NX36 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms