Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATAD3AQ9NVI7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms