Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms