Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTPS2Q9NRF8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms