Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC6A20Q9NP91 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms