Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NRDE2Q9H7Z3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms