Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTR3CQ9C0K3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms