Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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