Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms