Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms